Hola Evialia,
Entiendo que cuando dices que tienes problemas con esos 2 materiales, quieres decir que con 2 colores de, por ejemplo, ABS ¿eso no te pasa?
Te lo pregunto por si tu problema pueda deberse a un problema de ajuste en el eje Z entre las 2 boquillas, esto te puede dar problemas de adhesión entre 2 materiales que en teoría funcionan perfectamente.
Saludos!